El proyecto Tonina con folio 33290 se inició en 1980, y se ha dedicado a la investigación y conservación de la estructura urbana de la zona arqueológica de Tonina. La investigación principal gira en torno al estudio del urbanismo particular de Tonina, esto es el conocimiento espacio temporal de las partes y el todo del antiguo asentamiento, así como el estudio de las materias primas y sistemas constructivos, en fin, se estudia todo el proceso necesario para planear y construir los monumentos arqueológicos del México antiguo. Los trabajos de conservación se basan en el estudio de esta actividad en México y para este fin tenemos un proyecto de investigación paralelo para conocer las distintas tendencias y sus resultados a largo plazo. El proyecto ha estado enfocado en el estudio de los componentes del patrón de asentamiento y de las construcciones arquitectónicas que lo componen, para esto, al principio se empezó definiendo los conjuntos desde los estudios de la superficie del terreno, que se basaron en una topografía detallada, en la cual se definieron áreas urbanas y la disposición específica de los templos y palacios que los conforman, durante este tiempo se ha estado trabajando siguiendo siempre el mismo sistema técnico y metodológico, así una vez explorados los edificios se consolidan hasta donde lo permiten las estructuras mecánicas y visuales y se reestructuran, todo lo agregado repuesto o reacomodado se separa claramente de los restos arqueológicos originales, y se restituyen las porciones que devuelven la estabilidad y funcionalidad a las construcciones arquitectónicas. Actualmente se puede visitar casi la totalidad de la estructura urbana. Lo que resta por hacer ahora es un mantenimiento generalizado a largo plazo.