Jonuta se encuentra dentro de las Tierras Bajas Noroccidentales del área Maya, (Culbert 1973) en la margen derecha del río Usumacinta, importante vía de comunicación y comercio en la época prehispánica que nace en Guatemala y desemboca en la costa del Golfo de México, en el estado de Tabasco. De acuerdo con Lorenzo Ochoa, para el Clásico, la esfera de acción política de la cuenca del San Pedro y San Pablo, distributario del Usumacinta, estuvo en el puerto fluvial de Jonuta; sin embargo, a la llegada de grupos étnicos de habla nahua que intervinieron en los asuntos mercantiles de la región maya, los jonutecos perdieron prestigio ante los ocupantes del puerto comercial de Xicalango. En el Epiclásico y Posclásico temprano Xicalango desplazó a Jonuta en la esfera económica de la región. (Ochoa, 1997, pág. 96). No es sino hasta el siglo XX que las excavaciones de Heinrich Berlín, entre 1953 y 1954, arrojaron los primeros conocimientos arqueológicos sobre Jonuta prehispánico, mencionando entre otras cosas el uso de ladrillo para la construcción; es a partir de los estudios cerámicos procedentes de sus excavaciones y la abundante presencia de figurillas que coloca a Jonuta como un posible centro productor de cerámica de pasta fina, ubicando el asentamiento en una temporalidad de entre el 600 al 1350 d. de C. (Berlín, 1956). En 1979 las excavaciones de Carlos Álvarez y Luis Casasola del Proyecto Tierras Bajas Noroccidentales, refuerzan esta afirmación y propician la ampliación del estudio cerámico iniciado por Berlín. (Sánchez Caero, 1979) También en los años 70as del siglo pasado, Sánchez Caero presenta una breve descripción dela distribución del asentamiento prehispánico, lo que permite reconocer la orientación e identificar los montículos que han sido intervenidos arqueológicamente. (Sánchez Caero, 1979, pág. 27). Entre 2009 y 2013 Judith Gallegos realizo excavación arqueológica en Jonuta entregando como resultados de su investigación un informe parcial del que se rescata la presencia de un horno a cielo abierto, aunque no proporciona mayor información al respecto; así mismo asocia la presencia de muros de ladrillo a una unidad habitacional. Esta misma autora ha realizado estudios sobre las figurillas de Jonuta que permiten reconocer que su producción a base de moldes tuvo una amplia distribución en el área maya.