El proyecto surgió en el año 2015 (folio 11536) con la finalidad de emprender acciones integrales de rescate, regularización, investigación, conservación emergente y habilitación de la zona arqueológica, la cual recibía visita pública de manera informal desde muchos años atrás. Aunque el sitio había sido trabajado en forma esporádica desde hacía más de dos décadas, no se había establecido hasta entonces un proyecto permanente que diera atención a las necesidades cotidianas de la zona y que abordara de manera extensiva y sistemática su investigación. Los primeros años la atención de este proyecto se centró en la protección técnica y legal del sitio, así como en trabajos de adecuación de senderos y áreas de descanso para integrar un circuito de recorrido y acciones de restauración del entorno natural. Con la formalización de la apertura de la zona arqueológica en 2019, se ampliaron y diversificaron las tareas del proyecto para dar atención a los visitantes y asegurar la conservación del sitio en su nuevo contexto como espacio de uso público, mediante la implementación de acciones de manejo. Para atender estas necesidades operativas permanentes, se creó el Programa de Conservación Preventiva, Mantenimiento y Habilitación del Cerro de las Ventanas (folio 26110), con la finalidad de reservar para el presente proyecto (folio 30589) el ejercicio de los aspectos académicos.