Existe una recomendación del Órgano Interno de Control en la que solicita se alimente la base de datos del Sistema Único de Registro Público de Monumentos y Zonas Arqueológicos e Históricos. Por lo que, es de suma importancia contar con un equipo de trabajo que realice esta actividad de manera permanente. En las salas de exposiciones permanentes se exhiben piezas que han estado en las vitrinas desde 1976, en junio de 2014 se desmonto la sala 'Historia de Jalisco I' y se regresaron a Almacén de Colecciones 310 piezas HISTÓRICAS, piezas con las que inicio el proyecto El trabajo debe ser en tres niveles, el primer nivel es la revisión de la información que existe en las fichas de inventario a cargo de los integrantes del departamento de investigación. El segundo paso es el diagnostico de conservación de la piezas a cargo del departamento de restauración y el tercer paso será alimentar la base de datos con la correcta transcripción de la información. El museo no cuenta con personal calificado para realizar esta actividad razón por la que, es necesario contratar a tres personas con perfiles muy específicos para poder realizar las actividades de este proyecto, deben ser de nivel licenciatura y que conozcan el manejo de bases de datos, y que tengan la capacidad de transcribir las fichas técnicas que los curadores realicen de las colecciones.