El INAH Chiapas tiene habilitados y abiertos al público 6 museos, cinco de ellos abiertos al público, y uno, el Museo Arqueológico de Comitán, temporalmente cerrado por razones de mantenimiento. Los museos que se atienden directamente son el Museo Regional de Chiapas (ubicado en Tuxtla Gutiérrez), el Centro Cultural de los Altos de Chiapas (San Cristóbal de las Casas), Museo Arqueológico de Comitán (Comitán de Domínguez), Museo de Sitio de Toniná (Ocosingo), y Museo de Sitio Alberto Ruz L´Huillier de la zona arqueológica de palenque, este último administrado y operado por la subdirección de Palenque. La ubicación de cada uno presenta sus particularidades tanto ambientales como arquitectónicas, en consecuencia sus necesidades son diferentes. Con temáticas principalmente de patrimonio arqueológico e histórico, reciben anualmente no sólo al público local y escolar, pues al encontrarse en zonas turísticas cuentan con una afluencia importante de visitantes extranjeros. Durante el 2016 recibieron a poco más de 60,000 visitantes, entre nacionales y extranjeros. Para ofrecer una buena oferta culturales importante mantener en buenas condiciones la infraestructura de los museos, así como los elementos relacionados con las exposiciones fijas o permanentes, lo cual además de cumplir las necesidades de difusión debe responder a las necesidades de seguridad, control y condiciones de resguardo.