Este proyecto tuvo el folio 318 y dio inicio en 1997 como Seminario de Estudios Afromexicanos en la Dirección de Etnología y Antropología Social con una línea de investigación sobre las poblaciones afromexicanas. En 2008 inició una segunda etapa vinculándose con el Proyecto Internacional AFRODESC en el que participaban investigadores y estudiosos de distintos países de África, Europa y América Latina y con apoyo de recursos de la Agencia Europea. En 2013 comenzó la tercera etapa tendiendo como centro de adscripción la Coordinación Nacional de Antropología y convirtiéndose en un programa nacional de investigación; esta transformación también respondió a la creación del Decenio Internacional de las Personas Afrodescendientes 2015-2024 promulgado por la ONU. Como Programa se ha logrado la vinculación con Centros INAH y con otras instituciones académicas y dependencias del gobierno interesadas en el tema. En este periodo se recibió el apoyo del Programa de Ciencia Básica de CONACyT para llevar a cabo una investigación sobre racismo y afrodescendientes que culminó en 2019. Así mismo las actividades de este programa incidieron en el logró del reconocimiento de Cátedra Unesco a la línea de investigación sobre poblaciones de origen africano en el Posgrado de Historia y Etnohistoria de la ENAH. En la última etapa se logró concluir la investigación y se publicó un libro sobre el tema de racismo y afrodescendientes en México, así como la entrega del borrador de otra publicación sobre mujeres afromexicanas y experiencias de racismo. También se consolidó una red de trabajo con investigadores de Centros INAH, aunque es un reto de este programa fortalecer y motivar nuevas investigaciones sobre el tema en otros centros INAH. Se participó en el diplomado de Estudios Afrolatinoamericanos con la Universidad de Harvard. Además se asesoraron y dirigieron tesis de posgrado sobre el tema. También se logró incidir directamente en la aceptación del reconocimiento constitucional el 10 de agosto de 2019 con un apartado C en el Artículo 2do y la formulación de una pregunta de autoadscripción afromexicana o afrodescendientes en el Censo Nacional de Población y Vivienda 2020.