El términos generales el sitio arqueológico Comala se encuentra ubicado en una plataforma aluvial formada por los cauces de los arroyos San Juan (al oeste) y Suchitlán (al este). Específicamente el sitio linda con el arroyo Suchitlán al este y con un arroyo estacionario al oeste. El sitio presenta una disposición organizada a partir de la propia topografía determinada por el cauce de los arroyos, esto es, una disposición que va de NE a SW y que alcanza uno 1,350 m de largo en línea recta. Los elementos arquitectónicos que se conservan parecen organizarse en tres grandes plataformas: la norte, central y sur. El ancho mínimo de la plataforma se ubica a la altura de donde termina la plataforma central (250 m), el ancho máximo se alcanza a la altura del círculo mayor en la plataforma central (580 m). Es en la plataforma central donde se concentran los elementos arquitectónicos más relevantes consistentes en tres círculos de diámetros distintos.El círculo mayor (A) se encuentra cargado hacia el oeste de la plataforma central en su extremo NW. Su diámetro total es de unos 200 m, la plataforma exterior tiene unas dimensiones que varían entre lo 40 y los 30 m de ancho. El montículo central presenta una planta aproximada de unos 50 m de diámetro y una altura de uno 5 m de alto.El segundo círculo se encuentra ubicado al SE del primero, a una distancia aproximada de 90 m. Este círculo (B) presenta un diámetro aproximado de 110 m, su plataforma exterior mide como 30 m de ancho y su montículo central unos 25-30 m de diámetro y unos 4 m de altura. Finalmente, el tercer círculo (C) surge a partir de la plataforma sur de círculo B. El mismo mide unos 100 m de diámetro, su banqueta exterior alcanza los 20 m de ancho y al igual que el diámetro de su montículo central, mismo que presenta una altura aproximada de 3 m.