Las actividades realizadas dentro del laboratorio están enfocadas en el campo de investigación enfocado de la biología y las ciencias del suelo, que recuperan microrrestos del suelo para conocer las características antiguas de la vegetación y el clima del lugar. Los microrrestos recuperados son principalmente granos de polen, granos de almidón, fitolitos, diatomeas y esporas. Estos resultados nos permiten conocer el ambiente en el que se desarrollaban los grupos humanos antiguos, la vegetación que estaba a su alcance y cuáles de ellos eran consumidos.
Se llevan a cabo investigaciones, formación de alumnos para conocer las técnicas y metodologías adecuadas para la recuperación de microrrestos, talleres de difusión que contribuyen en el conocimiento de la paleodieta y el paleoambiente de los sitios arqueológicos.
Cuenta con equipo especializado para la recuperación de microrrestos como campana de extracción, centrifugas, microscopios biológicos, cámaras para microscopios, pipetas y cristalería de laboratorio.
En este espacio se resguardan alrededor de 3471 muestras de sedimento y láminas procesadas de diferentes proyectos y herbarios analizados dentro del laboratorio.
Asimismo, cerca de 20 estudiantes por semestre realizan prácticas, servicios social e investigaciones de tesis.
Hasta la fecha se han desarrollado 51 proyectos con temas de megafauna: Santiago Chazumba, Oaxaca o el rescate del Aeropuerto AIFA; así como proyectos relacionados a cazadores-recolectores, entierros como las tumbas de tiro de Colima, las momias prehispánicas del norte del país resguardadas por la DAF; zonas arqueológicas grandes como Teohituacan y cálculo dental de entierros coloniales, entre otros.
