El inicio de las investigaciones científicas modernas está marcado por los trabajos que realizó el inglés Alfred P. Maudslay a finales del siglo XIX y principios del XX, a él se debe el primer plano topográfico del sitio. En el siglo XX, comienzan las investigaciones sistemáticas de exploración, consolidación y restauración de Palenque, con los trabajos de Miguel Ángel Fernández, Alberto Ruz L´huillier y Jorge R. Acosta. En la década de los 50s, el Dr. Alberto Ruz, dedica todo su esfuerzo a explorar y restaurar la mayoría de los edificios que actualmente forman parte de las estructuras que el turismo puede apreciar durante el recorrido por el sitio. Con la ejecución de los macro-proyectos en la década de los 90, el Arqueólogo Arnoldo González Cruz, inicia trabajos de exploración, conservación y mantenimiento mayor en varias estructuras del área central de Palenque; dentro de una de las temporadas de campo, se logra efectuar el hallazgo de la Tumba de la Reina Roja. En este siglo XXI, y debido a que una de las labores sustantivas del Instituto Nacional de Antropología e Historia es la conservación del patrimonio cultural, se lleva a cabo como uno de los proyectos de continuidad de la zona arqueológica de Palenque, éste es el de mantenimiento menor de las zonas arqueológicas de Palenque, Bonampak y Yaxchilán, el cual recaía en el personal de custodia de cada sitio, a finales de la última década del siglo pasado, se implementó un proyecto para la contratación de personal eventual para dedicarse exclusivamente a estas actividades. Actualmente se ejecutan acciones de mantenimiento (limpieza, chapeo, desyerbe, recolección de basura y hojarasca, lavado de grava de andadores, arreglos de escalinatas, palapas, puentes, albañilería, fontanería, arreglo del sistema eléctrico, etc.) y conservación menor, tanto de las estructuras y andadores del sitio arqueológico, como de los edificios, palapas andadores y cunetas de la carretera de acceso a la zona arqueológica, que funcionan para el servicio del turismo nacional e internacional. Con esto, se ha logrado que el sitio patrimonial tenga una buena presentación para el público en general, para un mayor disfrute del recorrido por la antigua ciudad prehispánica.