En este trabajo de investigación se estudia la fonología del zapoteco de San Bartolo Yautepec, una variante de zapoteco sureño en alto riesgo de desaparecer. Esta lengua posee seis timbres vocálicos: tres anteriores y tres posteriores, y su sistema consonántico está compuesto por 22 segmentos de los cuales todos se encuentran dentro de una oposición fortis-lenis excepto los deslices. Las consonantes fortis presentan realizaciones fonéticas estables y más largas en todos los contextos mientras que las lenis tienen realizaciones más breves y tienden a asimilarse al contexto fonético que las rodea. El ZSBY es una lengua tonal y posee tres tonos a nivel fonológico: alto, bajo y ascendente. Existe un patrón tonal descendente el cual aparece únicamente en nominales inanimados en algunos contextos de frase, y se argumenta que este patrón descendente es causado por un tono alto flotante que funciona como marca de clase para los nominales inanimados. El ZSBY también contrasta voz modal con dos tipos de laringización a nivel fonológico los cuales caracterizo como laringización con anclaje medio y laringización con anclaje final. Se argumenta que existe un solo rasgo [+glotis constreñida] el cual se ancla a la primera o segunda mora de una sílaba acentuada dando como resultado los dos tipos de anclaje temporal de la laringización. Tanto el tono como la laringización se manifiestan en segmentos vocálicos y consonánticos con el rasgo [+resonante]. El rasgo [+glotis constreñida] únicamente se asocia a las consonantes resonantes cuando éstas se encuentran en posición de coda y son moraicas. Al final del trabajo se hace una revisión de la propuesta de escritura alfabética ya utilizada por la comunidad y se le hacen algunas propuestas de modificaciones para hacerla más simple y consistente con el análisis fonológico propuesto en este trabajo.