El laboratorio de investigación de la ENCRYM, realiza una labor relevante aplicando técnicas de la química analítica en la investigación y caracterización de materiales constitutivos de bienes culturales, apoyando los investigaciones de los seminarios taller de restauración, a las tesis de licenciatura de la ENCRYM, así como a diversas dependencias del INAH. El eje científico experimental tiene como objetivo general la enseñanza e investigación, que están profundamente vinculados con las actividades de formación de los seminarios taller de restauración, de tal forma que los resultados de las asesorías, análisis y prácticas se ven reflejados en la formación del estudiante, así como en los informes y tratamientos de conservación y restauración.