Este proyectos es de nueva creación, sin embargo, en el laboratorio de Paleobotánica están resguardados los materiales arqueológicos de naturaleza vegetal que proceden de sitios prehistóricos como las cuevas secas de Tehuacán, Puebla; en las cuevas "Guilá" y "Naquitz", en el estado de Oaxaca; cuevas "Guerrero" y "Valenzuela", en el estado de Tamaulipas y las cuevas "Candelaria" y "Pilas", en el estado de Coahuila, principalmente, además entre numerosas sitios prehispánicos a lo largo del país. Sin dejar de lado las posibles aportaciones del periodo colonial.