El programa Nacional de Conservación del Patrimonio Arqueológico tiene su origen en enero de 2014 dentro de la tarjeta de proyecto 'Programas Nacionales de Conservación del Patrimonio Cultural In Situ' con folio 8382. La importancia de desarrollar acciones planeadas, no sólo reactivas, en concordancia con las metas propuestas en el Plan Nacional de Desarrollo en el rubro de 'México con Educación de Calidad', impulsó a la CNCPC a plantear en el 2013 los diferentes programas nacionales de conservación, entre los que se incluyó el Programa Nacional de Conservación de Patrimonio Arqueológico in situ. Dicho programa surge con el objetivo de coordinar e impulsar la conservación del patrimonio arqueológico con una visión estratégica a nivel nacional y dirigir todos los esfuerzos y recursos materiales y humanos hacia las necesidades prioritarias, todo ello en el marco de un Plan Nacional de Conservación del Patrimonio Cultural. Durante 2015 como parte de la construcción del Programa Nacional, se conformó una base de datos de monumentos y sitios arqueológicos a nivel nacional a partir de bases existentes (SUR, Base de datos de Operación de Sitios CNA). De igual manera se elaboró un diagnóstico preliminar del estado de la cuestión de la conservación del patrimonio arqueológico in situ a nivel nacional, a partir del análisis de los mecanismos y herramientas de protección jurídica, indicadores de uso y valoración, distribución de recursos para actividades de conservación por parte de la CNCPC, plataformas existentes para la documentación del patrimonio y sus intervenciones, así como niveles de gobierno y organismos nacionales e internacionales que colaboran en la conservación. Durante 2016, dado que fue necesario apoyar acciones emergentes de conservación arqueológica, el objetivo del Programa de generar un inventario de bienes inmuebles por destino en zonas arqueológicas y sitios de monumentos, para promover la atención preventiva ordenada y la asignación estratégica de recursos, no pudo cumplirse. Para 2017 se retoma dicho objetivo en el marco del Programa Nacional de Conservación de Patrimonio Arqueológico in situ, mismo que articulará todas las acciones de conservación arqueológica de la CNCPC, concentrando los recursos con el fin de impulsar el desarrollo de estrategias nacionales que permitan ampliar la capacidad de atención y enfrentar los retos institucionales, además de dar seguimiento a las acciones desarrolladas en el marco de los proyectos de continuidad específicos vigentes hasta 2016 (8226, 8534, 11516, 11610, 12869, 16279), integrados ahora en el Programa.